新研究：一种儿童白血病有15种亚型，有望指导针对性治疗

美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院（Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania）的大卫·蒂奇（David T.Teachey）等人的一项研究发现，T细胞系急性淋巴细胞白血病（T-ALL，T-lineage acute lymphoblastic leukaemia）可以分为15种不同亚型，研究人员按风险等级对它们进行分类，这有助于医生为T细胞系急性淋巴细胞白血病患者推荐更有效的疗法。当地时间2024年8月14日，相关研究在线发表于《自然》（Nature）杂志。

据《自然》报道，T细胞系急性淋巴细胞白血病是未成熟T淋巴细胞在骨髓或淋巴组织中恶性增殖所导致的一种血液系统恶性肿瘤，约占儿童急性淋巴细胞白血病（ALL，acute lymphoblastic leukemia）的15%，所有儿科癌症的5%。目前，针对T-ALL的治疗手段相对有限，以高强度化疗为基础的药物治疗和造血干细胞移植为主。虽然T-ALL的生存率随着化疗的进步而提高，但患儿复发率达到15-20%。

“几项小型研究表明，T-ALL中生物学相关的改变有很大一部分发生在基因组的非编码区域。然而，很少有病例进行全基因组测序（WGS），这限制了关键基因组驱动因素的识别。”研究人员在论文中写道。

这项研究对1300多名接受相同治疗的T-ALL患儿的肿瘤及缓解样本的基因组和转录组测序进行了综合分析，并与恶性和正常T淋巴细胞前体的表观基因组和单细胞分析相结合，从而确定了15种具有不同基因组驱动因素、基因表达模式、发育状态和结果的亚型，包括以前未定义的etp样亚型和LMO2γδ样亚型。此外，研究还改进了已知亚型（如TAL1和TLX3）的分类。

据《自然》报道，研究发现的每个亚型都表现出独特的遗传改变和基因表达模式。患有某些亚型的人在治疗后更有可能在体内留下癌细胞，这可能导致疾病复发。此外，拥有其他亚型的人更有可能在没有癌症的情况下存活下来，而有一种亚型则更有可能在身体的其他部位导致另一种类型的癌症。

研究还发现，与T-ALL相关遗传变化中，近60%发生在不产生蛋白质但会影响基因活性的DNA片段中。这些改变通常会导致基因的不适当激活，从而促成癌症的发展。

利用基因和临床数据，研究人员将T-ALL划分了风险等级——非常高、高、低和非常低。“这种分类可能有助于医生为高风险患者推荐更强的化疗或新的免疫疗法，为风险较低的患者推荐更保守的治疗。”比利时佛兰芒生物技术研究所（Flemish Institute for Biotechnology）白血病遗传学研究员扬·库尔斯（Jan Cools）说。

尽管由于成本原因，这种“全基因组测序”尚未普及，但此项研究的合著者，美国圣裘德儿童研究医院（St. Jude Children’s Research Hospital）的血液病学家查尔斯·穆利根（Charles Mullighan）认为，它将在未来变得更加普遍。“正是这样的研究有力地表明，我们应该越来越多地对这些类型的白血病进行全基因组测序。”

参考资料：

1.https://www.nature.com/articles/s41586-024-07807-0

2.https://www.nature.com/articles/d41586-024-02613-0